Sehubungan dengan audit yang dilakukan oleh kantor akuntan publik Agus Wahjono atas laporan penerimaan dan pengeluaran Universitas PGRI Yogyakarta periode 1 September 2016 – 31 Agustus 2017, dapat disampaikan hasil bahwa: laporan penerimaan dan pengeluaran Universitas PGRI Yogyakarta periode 1 September 2016 – 31 Agustus 2017 menyajikan secara wajar, dalam semua hal yang material dan disajikan secara cash basis sesuai dengan basis akuntansi komprehensif selain prinsip akuntansi umum di indonesia.